1964 in Dessau geboren / Studium an der Hochschule für Schauspielkunst „Ernst Busch" in Berlin. / Engagements am Volkstheater Rostock und am Theater Waidspeicher in Erfurt. / Seit 1995 künstlerischer Leiter am Puppentheater der Stadt Halle / Seit 2001 Intendant am Puppentheater Halle.

Unter Christoph Werners Leitung formierte sich das Puppentheater Halle neu. Große Co-Produktionen mit den Wiener Festwochen, dem Schauspielhaus Köln, dem Staatstheater Stuttgart, der Volksbühne Berlin, dem Opernhaus Halle gehören ebenso zu diesem neuen Profil wie auch kleine, weltweit erfolgreiche Inszenierungen wie beispielsweise „Kannst Du pfeifen Johanna" oder „Die Werkstatt der Schmetterlinge". 2005 wird Christoph Werner Nachfolger von Peter Sodann und leitet fortan neben dem Puppentheater auch das Schauspielhaus. Bereits im ersten Jahr seiner Intendanz wird das Neue Theater Halle zum Berliner Theatertreffen eingeladen. 2005 wird Christoph Werner vom Internationalen Theaterinstitut, der Stadt Halle und dem Land Sachsen-Anhalt zum Intendanten des Festivals „Theater der Welt" bestellt. Bis 2008 bereitet er gemeinsam mit dem Kurator Torsten Maß dieses theatrale Großereignis für Halle vor. Sowohl beim Publikum als auch bei der Presse wird „Theater der Welt" 2008 in Halle ein überwältigender Erfolg.

Über drei Spielzeiten erstreckt sich seit 2009/10 das Projekt »Ma chambre froide«, welche das Puppentheater Halle gemeinsam mit der von Joël Pommerat geleiteten Compagnie Louis Broulliard in Frankreich und Deutschland zusammenführt. Im Rahmen des Fonds »Wanderlust« fördert die Kulturstiftung des Bundes die gemeinsame Erarbeitung einer Uraufführung in zwei Inszenierungen: Einer französischen Schauspiel- Inszenierung und einer deutschen Puppentheaterinszenierung. Die Uraufführung von Joël Pommerats neuestem Stück „Ma chambre froide" in Paris, die Erstaufführung der deutschen Fassung „Meine Kältekammer" als Puppentheater-Variante in Halle, sowie abschließend gegenseitige Gastspiele in der Spielzeit 2011/12. Mit der Spielzeit 2010/11 übernimmt Christoph Werner wieder ausschließlich die Intendanz des Puppentheaters. Als Regisseur hat Christoph Werner in allen Genres gearbeitet. Sein besonderes Interesse gilt dabei der Verknüpfung von Menschen- und Puppentheater. Zahlreiche Preise auf einschlägigen Festivals, Tourneen durch Europa, Amerika und Asien dokumentieren seine Arbeit. Seine Stücke erscheinen im Verlag Hartmann & Stauffacher, im Mitteldeutschen Verlag erschien seine Erzählung „Josefs Geschichte", im Hasenverlag erschien zuletzt „Glücklicher Tod eines Rebellen". Er inszenierte unter anderem "Der erste Traum des Leuchtturmwärters" und "Die Werkstatt der Schmetterlinge", neben dem Stück "Meine Kältekammer" gehört "Konzert für eine taube Seele", mit Ragna Schirmer zu den Neuinszenierungen dieser Spielzeit.